A Coordenação de Transportes (CTr) está localizada na Garagem da Prefeitura e atualmente conta com 320 veículos, entre automóveis de passeio, motos, tratores, reboques, microônibus, caminhonetes e caminhões, esses veículos são disponibilizados para os Centros de Custo mediante prévia solicitação.

As solicitações de transporte devem ser feitas por meio do Sistema de Pedidos de Transportes (SITRAN) ou SEI. O cadastramento para agendamento de transportes no SITRAN deve ser feito através de memorando encaminhado à Prefeitura da UnB e deve estar de acordo com as instruções do Comunicado da Prefeitura Nº 52/2015.